căutarea similarității secvenței de explozie
efectuarea unei căutări de explozie…
- selectați fila ‘explozie’ din bara de instrumente din partea de sus a paginii pentru a rula o căutare de similitudine a secvenței cu programul explozie.
- introduceți fie o secvență de proteine sau nucleotide, fie un identificator UniProt în câmpul de formular (figura 37).
- Faceți clic pe butonul ‘Run Blast’.
căutările Blast pot fi rulate direct din butonul „Blast” din paginile de intrare UniProt. Toate paginile cu rezultate relevante (cum ar fi UniProtKB, UniRef, uniparc și rezultatele instrumentului) vă permit să rulați o căutare Blast direct selectând o intrare folosind o casetă de selectare. Puteți rula, de asemenea, căutări explozie din cadrul ‘Coș’.
sunt acceptate următoarele tipuri de identificatori UniProt:
| P00750 | UniProtKB entry |
| P00750-2 | UniProtKB entry isoform sequence |
| P00750 | Part of UniProtKB entry sequence, from its 1st to 20th amino acid residue (inclusive) |
| A4_HUMAN | UniProtKB entry name |
| UPI0000000001 | UniParc entry |
| UniRef100_P00750 | UniRef entry |
If you selectați fila ‘Blast’ a barei de instrumente dintr-o pagină de intrare UniProtKB, UniRef sau UniParc, secvența curentă este preumplută în formular.
joburile au identificatori unici, care (în funcție de tipul jobului) pot fi utilizați în interogări (de exemplu, pentru a obține intersecția a două căutări de similitudine a secvențelor). Identificatorii de locuri de muncă și datele aferente sunt păstrate timp de șapte zile și apoi sunt șterse.
setări opționale
o listă de setări opționale pentru căutarea Blast poate fi găsită în secțiunea Ajutor.