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pesquisa por semelhança da sequência de explosão

realização de uma pesquisa por explosão …

  1. seleccione a página ‘explosão’ da barra de ferramentas no topo da página para executar uma pesquisa por semelhança de sequência com o programa Blast.
  2. introduza uma sequência de proteínas ou nucleótidos ou um identificador UniProt no campo da forma (figura 37).carregue no botão’ Executar a explosão’.
Figura 37, A Explosão de página de entrada.

as buscas por explosão podem ser executadas directamente a partir do botão ‘Blast’ nas páginas de entrada do UniProt. Todas as páginas de resultados relevantes (como o UniProtKB, o UniRef, o UniParc e os resultados da ferramenta) permitem-lhe executar uma pesquisa em explosão directamente, seleccionando um item com uma opção. Você também pode executar buscas de explosão a partir de dentro da ‘cesta’.são suportados os seguintes tipos de identificadores UniProt::

P00750 UniProtKB entry
P00750-2 UniProtKB entry isoform sequence
P00750 Part of UniProtKB entry sequence, from its 1st to 20th amino acid residue (inclusive)
A4_HUMAN UniProtKB entry name
UPI0000000001 UniParc entry
UniRef100_P00750 UniRef entry

If you seleccione a página ‘Blast’ da barra de ferramentas numa página de entrada UniProtKB, UniRef ou UniParc; a sequência actual é pré-preenchida no formulário.

Jobs têm identificadores únicos, que (dependendo do tipo de trabalho) podem ser usados em consultas (por exemplo, para obter a intersecção de duas pesquisas de similaridade de seqüências). Os identificadores de trabalho e os dados relacionados são mantidos por sete dias, e então são apagados.

configuração opcional

uma lista de opções opcionais para a sua pesquisa Blast pode ser encontrada na secção de Ajuda.