BLAST sequence similarity searching
utför en Blast-sökning…
- välj fliken ’Blast’ i verktygsfältet högst upp på sidan för att köra en sekvenslikhetssökning med Blast-programmet.
- ange antingen en protein-eller nukleotidsekvens eller en UniProt-identifierare i formfältet (figur 37).
- Klicka på knappen ’Kör Blast’.
Blast sökningar kan köras direkt från knappen ”Blast” i UniProt ingångssidor. Alla relevanta resultatsidor (som UniProtKB, UniRef, UniParc och tool results) låter dig köra en Blast-sökning direkt genom att markera en post med en kryssruta. Du kan också köra Blast sökningar inifrån ’korg’.
följande typer av UniProt-identifierare stöds:
| P00750 | UniProtKB entry |
| P00750-2 | UniProtKB entry isoform sequence |
| P00750 | Part of UniProtKB entry sequence, from its 1st to 20th amino acid residue (inclusive) |
| A4_HUMAN | UniProtKB entry name |
| UPI0000000001 | UniParc entry |
| UniRef100_P00750 | UniRef entry |
If you välj fliken ’Blast’ i verktygsfältet från en UniProtKB -, UniRef-eller UniParc-ingångssida, den aktuella sekvensen är förfylld i formuläret.
jobb har unika identifierare, som (beroende på Jobbtyp) kan användas i frågor (t.ex. för att få skärningspunkten mellan två sekvenslikhetssökningar). Jobbidentifierare och relaterade data sparas i sju dagar och raderas sedan.
valfria inställningar
en lista med valfria inställningar för din Blast-sökning Finns i hjälpavsnittet.