zoeken naar overeenkomsten met BLASTSEQUENTIES
Een Blast-zoekopdracht uitvoeren…
- Selecteer het tabblad ‘Blast’ van de werkbalk bovenaan de pagina om een zoekopdracht met het Blast-programma uit te voeren.
- voer een eiwit-of nucleotidesequentie of een UniProt-identifier in het formulierveld in (Figuur 37).
- klik op de knop’ Run Blast’.
Blast-zoekopdrachten kunnen direct worden uitgevoerd vanaf de knop ‘Blast’ in UniProt-invoerpagina ‘ s. Op alle relevante resultatenpagina ‘ s (zoals UniProtKB, UniRef, UniParc en tool results) kunt u een Blast search direct uitvoeren door een item te selecteren met behulp van een selectievakje. U kunt ook Blast zoekopdrachten uitvoeren vanuit de’mand’.
De volgende soorten UniProt-identifiers worden ondersteund:
| P00750 | UniProtKB entry |
| P00750-2 | UniProtKB entry isoform sequence |
| P00750 | Part of UniProtKB entry sequence, from its 1st to 20th amino acid residue (inclusive) |
| A4_HUMAN | UniProtKB entry name |
| UPI0000000001 | UniParc entry |
| UniRef100_P00750 | UniRef entry |
If you selecteer het tabblad ‘Blast’ van de werkbalk van een UniProtKB, UniRef of UniParc invoerpagina, de huidige reeks wordt vooraf ingevuld in het formulier.
taken hebben unieke identifiers, die (afhankelijk van het type taak) kunnen worden gebruikt in queries (bijvoorbeeld om de kruising van twee sequentievergelijkingen te krijgen). Taak-ID ‘ s en de bijbehorende gegevens worden zeven dagen bewaard en vervolgens verwijderd.
optionele instellingen
een lijst met optionele instellingen voor uw Blast-zoekopdracht kunt u vinden in de help-sectie.