BLAST sekvenční podobnost hledání
Provedení Výbuch hledat…
- Vyberte „Výbuch“ kartu na panelu nástrojů v horní části stránky spustit sekvenční podobnost vyhledávání pomocí Blast programu.
- zadejte do pole formuláře buď proteinovou nebo nukleotidovou sekvenci nebo identifikátor Uniprotu (obrázek 37).
- klikněte na tlačítko „Spustit výbuch“.
vyhledávání výbuchů lze spustit přímo z tlačítka „Blast“ na vstupních stránkách UniProt. Všechny relevantní stránky s výsledky (například UniProtKB, UniRef, UniParc a výsledky nástrojů) umožňují spustit vyhledávání výbuch přímo výběrem položky pomocí zaškrtávacího políčka. Můžete také spustit výbuch vyhledávání v rámci „koše“.
jsou podporovány následující typy identifikátorů UniProt:
P00750 | UniProtKB entry |
P00750-2 | UniProtKB entry isoform sequence |
P00750 | Part of UniProtKB entry sequence, from its 1st to 20th amino acid residue (inclusive) |
A4_HUMAN | UniProtKB entry name |
UPI0000000001 | UniParc entry |
UniRef100_P00750 | UniRef entry |
If you vyberte kartu ‚Blast‘ na panelu nástrojů ze vstupní stránky UniProtKB, UniRef nebo UniParc, aktuální sekvence je předvyplněna ve formuláři.
Práce mají jedinečné identifikátory, které (v závislosti na typ úlohy) lze použít v dotazech (např. získat průsečík dvou sekvenční podobnost vyhledávání). Identifikátory úlohy a související údaje jsou uchovávány po dobu sedmi dnů a poté jsou vymazány.
volitelná nastavení
seznam volitelných nastavení pro vyhledávání výbuchů naleznete v části Nápověda.