BLAST sekvens lighed søgning
udførelse af en Blast søgning…
- vælg fanen ‘Blast’ på værktøjslinjen øverst på siden for at køre en sekvens lighed søgning med Blast-programmet.
- indtast enten en protein-eller nukleotidsekvens eller en UniProt-identifikator i formularfeltet (figur 37).
- Klik på knappen ‘Kør Blast’.
Blast-søgninger kan køres direkte fra knappen ‘Blast’ på UniProt-indgangssider. Alle relevante resultatsider (såsom UniProtKB, UniRef, UniParc og værktøjsresultater) giver dig mulighed for at køre en Blast-søgning direkte ved at markere en post ved hjælp af et afkrydsningsfelt. Du kan også køre Blast søgninger inde fra ‘kurv’.
følgende typer UniProt-identifikatorer understøttes:
| P00750 | UniProtKB entry |
| P00750-2 | UniProtKB entry isoform sequence |
| P00750 | Part of UniProtKB entry sequence, from its 1st to 20th amino acid residue (inclusive) |
| A4_HUMAN | UniProtKB entry name |
| UPI0000000001 | UniParc entry |
| UniRef100_P00750 | UniRef entry |
If you vælg fanen ‘Blast’ på værktøjslinjen fra en UniProtKB -, UniRef-eller UniParc-indgangsside, den aktuelle sekvens udfyldes i formularen.
job har unikke identifikatorer, som (afhængigt af jobtypen) kan bruges i forespørgsler (f.eks. for at få krydset mellem to sekvenslignende søgninger). Jobidentifikatorer og de relaterede data opbevares i syv dage og slettes derefter.
valgfrie indstillinger
en liste over valgfrie indstillinger til din Blast-søgning kan findes i afsnittet Hjælp.