Búsqueda de similitud de secuencia de explosión
Realizar una búsqueda de explosión Select
- Seleccione la pestaña «Explosión» de la barra de herramientas en la parte superior de la página para ejecutar una búsqueda de similitud de secuencia con el programa de explosión.
- Introduzca una secuencia de proteínas o nucleótidos o un identificador UniProt en el campo de formulario (Figura 37).
- Haga clic en el botón «Ejecutar explosión».
Las búsquedas de Blast se pueden ejecutar directamente desde el botón «Blast» en las páginas de entrada de UniProt. Todas las páginas de resultados relevantes (como UniProtKB, UniRef, UniParc y resultados de herramientas) le permiten ejecutar una búsqueda directa seleccionando una entrada utilizando una casilla de verificación. También puedes realizar búsquedas explosivas desde la ‘Cesta’.
Se admiten los siguientes tipos de identificadores UniProt:
P00750 | UniProtKB entry |
P00750-2 | UniProtKB entry isoform sequence |
P00750 | Part of UniProtKB entry sequence, from its 1st to 20th amino acid residue (inclusive) |
A4_HUMAN | UniProtKB entry name |
UPI0000000001 | UniParc entry |
UniRef100_P00750 | UniRef entry |
If you seleccione la pestaña ‘Blast’ de la barra de herramientas desde una página de entrada UniProtKB, UniRef o UniParc, la secuencia actual se rellena previamente en el formulario.
Los trabajos tienen identificadores únicos, que (dependiendo del tipo de trabajo) se pueden usar en consultas (por ejemplo, para obtener la intersección de dos búsquedas de similitud de secuencias). Los identificadores de trabajo y los datos relacionados se conservan durante siete días y luego se eliminan.
Ajustes opcionales
En la sección de ayuda se puede encontrar una lista de ajustes opcionales para la búsqueda de explosiones.