BLAST sequence similarity searching
Durchführen einer Blast-Suche…
- Wählen Sie die Registerkarte ‚Blast‘ in der Symbolleiste oben auf der Seite, um eine Sequenzähnlichkeitssuche mit dem Blast-Programm durchzuführen.
- Geben Sie entweder eine Protein- oder Nukleotidsequenz oder einen UniProt-Bezeichner in das Formularfeld ein (Abbildung 37).
- Klicken Sie auf die Schaltfläche ‚Run Blast‘.
Blast-Suchen können direkt über die Schaltfläche „Blast“ auf den UniProt-Einstiegsseiten ausgeführt werden. Auf allen relevanten Ergebnisseiten (z.B. UniProtKB, UniRef, UniParc und Werkzeugergebnisse) können Sie direkt eine Blast-Suche durchführen, indem Sie einen Eintrag über ein Kontrollkästchen auswählen. Sie können auch Blast-Suchen aus dem ‚Korb‘ ausführen.
Die folgenden Arten von UniProt-Bezeichnern werden unterstützt:
| P00750 | UniProtKB entry |
| P00750-2 | UniProtKB entry isoform sequence |
| P00750 | Part of UniProtKB entry sequence, from its 1st to 20th amino acid residue (inclusive) |
| A4_HUMAN | UniProtKB entry name |
| UPI0000000001 | UniParc entry |
| UniRef100_P00750 | UniRef entry |
If you wählen Sie auf einer UniProtKB-, UniRef- oder UniParc-Einstiegsseite die Registerkarte ‚Blast‘ der Symbolleiste aus.
Jobs haben eindeutige Bezeichner, die (abhängig vom Jobtyp) in Abfragen verwendet werden können (z. B. um den Schnittpunkt zweier Sequenzähnlichkeitssuchen zu ermitteln). Job-Identifikatoren und die damit verbundenen Daten werden sieben Tage lang aufbewahrt und anschließend gelöscht.
Optionale Einstellungen
Eine Liste der optionalen Einstellungen für Ihre Blast-Suche finden Sie im Hilfebereich.