Recherche de similarité de séquence de BLAST
Effectuer une recherche de Blast
- Sélectionnez l’onglet « Blast » de la barre d’outils en haut de la page pour exécuter une recherche de similarité de séquence avec le programme Blast.
- Entrez une séquence de protéines ou de nucléotides ou un identifiant UniProt dans le champ de formulaire (Figure 37).
- Cliquez sur le bouton « Lancer l’explosion « .
Les recherches de Blast peuvent être exécutées directement à partir du bouton « Blast » dans les pages d’entrée UniProt. Toutes les pages de résultats pertinentes (telles que les résultats UniProtKB, UniRef, UniParc et tool) vous permettent d’exécuter une recherche directe en sélectionnant une entrée à l’aide d’une case à cocher. Vous pouvez également lancer des recherches de souffle à partir du « Panier ».
Les types d’identifiants UniProt suivants sont pris en charge:
| P00750 | UniProtKB entry |
| P00750-2 | UniProtKB entry isoform sequence |
| P00750 | Part of UniProtKB entry sequence, from its 1st to 20th amino acid residue (inclusive) |
| A4_HUMAN | UniProtKB entry name |
| UPI0000000001 | UniParc entry |
| UniRef100_P00750 | UniRef entry |
If you sélectionnez l’onglet « Blast » de la barre d’outils à partir d’une page d’entrée UniProtKB, UniRef ou UniParc, la séquence en cours est préremplie dans le formulaire.
Les travaux ont des identifiants uniques, qui (selon le type de travail) peuvent être utilisés dans des requêtes (par exemple pour obtenir l’intersection de deux recherches de similarité de séquence). Les identifiants d’emploi et les données associées sont conservés pendant sept jours, puis supprimés.
Paramètres optionnels
Une liste des paramètres optionnels pour votre recherche Blast se trouve dans la section d’aide.